Blue & Green Troia Design Hotelin kaikissa ihastuttavissa ja tilavissa huoneissa ja huoneistoissa on oma ihanilla merinäköaloilla varustettu parveke tai terassi. Jokaisen tyylikkään huoneen varustukseen kuuluu lisäksi ilmastointi, Nespresso-kahvinkeitin, taulu-tv, kylpytakit ja tohvelit sekä kylpyhuoneessa erilliset seisova amme ja sadesuihku. Yhden - kolmen makuuhuoneen huoneistoista löytyy lisäksi oleskelutila ja pieni keittiö.
Hotellissa on seuraavanlaisia huonekategorioita: Deluxe Room, Deluxe Studio, Premium Apartment, Master Apartment, Master Apartment Marina View ja Grand Apartment.